上海理工大学环境科学与工程系（原环境工程系）建于1997年4月，现有在职专职教师47名，其中正教授6名、副教授25名，具有博士学位（含在读博士）的教师41名，34人具有海外留学的经历。

环境科学与工程系于1997年开始招收环境工程专业本科生，2004年开始招收环境工程专业工学硕士研究生，2007年开始招收环境科学与工程专业工学硕士研究生，2010年开始招收能源与环境工程专业工学博士研究生，2009年开始招收环境工程工程领域专业硕士研究生。自2011年到2019年本科生就业率平均每年98%，研究生的就业率100%。

该系现拥有上海市教委重点实验室“环境科学与工程重点实验室”，机械工业联合会煤（气）高效燃烧与超低排放重点实验室、上海市高校环境工程教育高地平台，上海市青少年创新人才培养基地：上海理工大学环境科学与工程实践工作站。实验中心面积约为2000 平方米，实验仪器、实验装置和专业软件等价值达3000 余万。

现有能源与环境工程博士点1个，环境科学与工程一级学科硕士点1个，环境工程、环境科学硕士点2个，工程领域专业硕士点1个，环境工程本科专业点1个。环境工程本科专业2018年通过中国工程教育认证，2019年进入国家级一流本科专业建设“双万计划”建设点名单。近三年获得20 余项国家自然科学基金和863 项目，各类研究经费达3100 余万。发表SCI论文250 多篇，其中ESI 高被引论文19 篇。该学科与美国、加拿大、瑞典、日本和韩国多所大学具有长期合作关系，近三年3 名教师赴美国、加拿大和欧盟进行合作研究。该系曾荣获国家级科技奖2项，省部科技奖7项。

由于本系教师在教学、科研方面的突出表现，上海理工大学环境科学与工程系教学科研团队于2012年4月荣获“上海市青年五四奖章集体”称号。2016年3月获得上海市“巾帼文明岗”称号。